Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NFKB2Q00653 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NFKB2Q00653 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms