Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeboxP70368 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeboxP70368 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeboxP70368 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SeboxP70368 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SeboxP70368 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms