Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HERVK_113P62684 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HERVK_113P62684 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms