Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP4BP1P59074 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP4BP1P59074 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms