Protein–RNA interactions for Protein: P51677

CCR3, C-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR3P51677 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR3P51677 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR3P51677 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR3P51677 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR3P51677 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR3P51677 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR3P51677 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR3P51677 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR3P51677 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR3P51677 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCR3P51677 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR3P51677 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR3P51677 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR3P51677 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR3P51677 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR3P51677 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR3P51677 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR3P51677 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR3P51677 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR3P51677 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR3P51677 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR3P51677 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR3P51677 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCR3P51677 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR3P51677 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR3P51677 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR3P51677 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR3P51677 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR3P51677 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR3P51677 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR3P51677 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR3P51677 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR3P51677 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR3P51677 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR3P51677 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR3P51677 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR3P51677 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCR3P51677 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR3P51677 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR3P51677 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR3P51677 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR3P51677 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR3P51677 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR3P51677 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR3P51677 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR3P51677 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR3P51677 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR3P51677 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR3P51677 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCR3P51677 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR3P51677 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR3P51677 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR3P51677 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR3P51677 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR3P51677 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR3P51677 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR3P51677 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR3P51677 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR3P51677 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR3P51677 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR3P51677 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCR3P51677 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR3P51677 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR3P51677 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR3P51677 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR3P51677 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR3P51677 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR3P51677 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR3P51677 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR3P51677 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR3P51677 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR3P51677 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR3P51677 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCR3P51677 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR3P51677 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR3P51677 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR3P51677 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR3P51677 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR3P51677 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR3P51677 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR3P51677 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR3P51677 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR3P51677 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR3P51677 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR3P51677 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR3P51677 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR3P51677 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR3P51677 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR3P51677 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR3P51677 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR3P51677 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR3P51677 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCR3P51677 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR3P51677 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR3P51677 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR3P51677 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR3P51677 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR3P51677 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR3P51677 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCR3P51677 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms