Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gbx2P48031 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gbx2P48031 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms