Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL1P40616 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL1P40616 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL1P40616 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARL1P40616 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL1P40616 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL1P40616 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL1P40616 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL1P40616 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL1P40616 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL1P40616 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARL1P40616 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARL1P40616 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ARL1P40616 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ARL1P40616 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARL1P40616 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL1P40616 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL1P40616 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL1P40616 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL1P40616 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL1P40616 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL1P40616 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARL1P40616 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL1P40616 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL1P40616 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL1P40616 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARL1P40616 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARL1P40616 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL1P40616 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL1P40616 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL1P40616 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARL1P40616 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARL1P40616 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL1P40616 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARL1P40616 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARL1P40616 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARL1P40616 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL1P40616 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARL1P40616 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL1P40616 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL1P40616 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARL1P40616 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARL1P40616 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARL1P40616 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ARL1P40616 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARL1P40616 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARL1P40616 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARL1P40616 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARL1P40616 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARL1P40616 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ARL1P40616 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARL1P40616 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARL1P40616 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ARL1P40616 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARL1P40616 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARL1P40616 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARL1P40616 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARL1P40616 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARL1P40616 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARL1P40616 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARL1P40616 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARL1P40616 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARL1P40616 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARL1P40616 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARL1P40616 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARL1P40616 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARL1P40616 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARL1P40616 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARL1P40616 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARL1P40616 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARL1P40616 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARL1P40616 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARL1P40616 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARL1P40616 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARL1P40616 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARL1P40616 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARL1P40616 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARL1P40616 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARL1P40616 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms