Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
IGHMBP2P38935 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGHMBP2P38935 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IGHMBP2P38935 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IGHMBP2P38935 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IGHMBP2P38935 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
IGHMBP2P38935 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGHMBP2P38935 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGHMBP2P38935 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGHMBP2P38935 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGHMBP2P38935 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGHMBP2P38935 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGHMBP2P38935 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGHMBP2P38935 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
IGHMBP2P38935 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGHMBP2P38935 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IGHMBP2P38935 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms