Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab17P35292 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab17P35292 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab17P35292 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab17P35292 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab17P35292 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab17P35292 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab17P35292 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab17P35292 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab17P35292 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab17P35292 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab17P35292 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab17P35292 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab17P35292 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms