Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPC1P35052 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPC1P35052 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPC1P35052 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPC1P35052 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPC1P35052 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPC1P35052 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPC1P35052 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPC1P35052 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPC1P35052 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GPC1P35052 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPC1P35052 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPC1P35052 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPC1P35052 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GPC1P35052 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GPC1P35052 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC1P35052 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC1P35052 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC1P35052 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC1P35052 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC1P35052 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC1P35052 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC1P35052 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC1P35052 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC1P35052 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC1P35052 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC1P35052 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC1P35052 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC1P35052 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC1P35052 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GPC1P35052 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC1P35052 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC1P35052 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC1P35052 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC1P35052 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC1P35052 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC1P35052 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC1P35052 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC1P35052 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC1P35052 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC1P35052 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC1P35052 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC1P35052 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC1P35052 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC1P35052 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC1P35052 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC1P35052 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC1P35052 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GPC1P35052 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC1P35052 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC1P35052 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC1P35052 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC1P35052 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC1P35052 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC1P35052 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC1P35052 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC1P35052 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC1P35052 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC1P35052 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC1P35052 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC1P35052 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC1P35052 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC1P35052 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GPC1P35052 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC1P35052 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC1P35052 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC1P35052 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC1P35052 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC1P35052 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC1P35052 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC1P35052 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC1P35052 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC1P35052 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC1P35052 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC1P35052 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC1P35052 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC1P35052 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC1P35052 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GPC1P35052 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms