Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DUSP1P28562 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms