Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDE4AP27815 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE4AP27815 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms