Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CRYBB3P26998 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRYBB3P26998 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms