Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
HOXB1P14653 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
HOXB1P14653 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms