Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApcsP12246 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApcsP12246 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ApcsP12246 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApcsP12246 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ApcsP12246 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ApcsP12246 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms