Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMEM225BP0DP42 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM225BP0DP42 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms