Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC166P0CW27 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC166P0CW27 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms