Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTAP09496 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTAP09496 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTAP09496 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLTAP09496 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTAP09496 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTAP09496 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTAP09496 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTAP09496 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTAP09496 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTAP09496 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTAP09496 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTAP09496 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTAP09496 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLTAP09496 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTAP09496 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTAP09496 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTAP09496 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTAP09496 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTAP09496 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTAP09496 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTAP09496 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTAP09496 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTAP09496 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTAP09496 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTAP09496 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLTAP09496 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTAP09496 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTAP09496 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTAP09496 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTAP09496 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTAP09496 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTAP09496 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTAP09496 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTAP09496 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTAP09496 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTAP09496 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTAP09496 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTAP09496 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTAP09496 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTAP09496 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLTAP09496 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLTAP09496 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLTAP09496 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLTAP09496 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLTAP09496 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLTAP09496 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLTAP09496 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTAP09496 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTAP09496 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTAP09496 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTAP09496 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTAP09496 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTAP09496 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTAP09496 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLTAP09496 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTAP09496 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTAP09496 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTAP09496 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTAP09496 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTAP09496 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTAP09496 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTAP09496 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTAP09496 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTAP09496 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTAP09496 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTAP09496 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTAP09496 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLTAP09496 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTAP09496 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTAP09496 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTAP09496 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTAP09496 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTAP09496 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTAP09496 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTAP09496 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTAP09496 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTAP09496 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTAP09496 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTAP09496 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTAP09496 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLTAP09496 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTAP09496 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTAP09496 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTAP09496 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTAP09496 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTAP09496 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTAP09496 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTAP09496 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTAP09496 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTAP09496 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTAP09496 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTAP09496 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTAP09496 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTAP09496 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTAP09496 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLTAP09496 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTAP09496 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTAP09496 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLTAP09496 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms