Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCA5LO95447 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCA5LO95447 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms