Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GCATO75600 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCATO75600 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCATO75600 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCATO75600 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCATO75600 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCATO75600 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCATO75600 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GCATO75600 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GCATO75600 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCATO75600 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCATO75600 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCATO75600 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCATO75600 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GCATO75600 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCATO75600 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCATO75600 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCATO75600 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCATO75600 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCATO75600 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCATO75600 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCATO75600 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCATO75600 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCATO75600 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCATO75600 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCATO75600 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GCATO75600 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCATO75600 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCATO75600 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCATO75600 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCATO75600 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCATO75600 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCATO75600 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCATO75600 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GCATO75600 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCATO75600 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GCATO75600 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCATO75600 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCATO75600 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GCATO75600 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCATO75600 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GCATO75600 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCATO75600 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCATO75600 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCATO75600 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCATO75600 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCATO75600 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCATO75600 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCATO75600 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCATO75600 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GCATO75600 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCATO75600 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCATO75600 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCATO75600 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCATO75600 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCATO75600 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCATO75600 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCATO75600 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCATO75600 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCATO75600 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCATO75600 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCATO75600 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCATO75600 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GCATO75600 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCATO75600 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCATO75600 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCATO75600 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCATO75600 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GCATO75600 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCATO75600 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCATO75600 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCATO75600 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCATO75600 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GCATO75600 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCATO75600 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCATO75600 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCATO75600 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCATO75600 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCATO75600 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCATO75600 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCATO75600 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCATO75600 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCATO75600 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCATO75600 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCATO75600 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCATO75600 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GCATO75600 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCATO75600 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCATO75600 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCATO75600 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCATO75600 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCATO75600 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCATO75600 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GCATO75600 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCATO75600 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCATO75600 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCATO75600 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCATO75600 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCATO75600 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GCATO75600 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms