Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSCO60682 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSCO60682 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSCO60682 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MSCO60682 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSCO60682 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSCO60682 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MSCO60682 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSCO60682 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSCO60682 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MSCO60682 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MSCO60682 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSCO60682 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSCO60682 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSCO60682 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSCO60682 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSCO60682 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MSCO60682 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSCO60682 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSCO60682 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSCO60682 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSCO60682 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSCO60682 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSCO60682 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MSCO60682 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSCO60682 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MSCO60682 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSCO60682 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MSCO60682 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSCO60682 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSCO60682 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSCO60682 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSCO60682 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSCO60682 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSCO60682 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSCO60682 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSCO60682 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSCO60682 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MSCO60682 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MSCO60682 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSCO60682 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSCO60682 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSCO60682 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MSCO60682 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSCO60682 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSCO60682 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSCO60682 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSCO60682 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSCO60682 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSCO60682 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSCO60682 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSCO60682 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSCO60682 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSCO60682 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSCO60682 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSCO60682 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSCO60682 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSCO60682 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MSCO60682 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MSCO60682 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSCO60682 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSCO60682 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSCO60682 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSCO60682 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSCO60682 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSCO60682 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSCO60682 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSCO60682 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSCO60682 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSCO60682 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSCO60682 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSCO60682 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSCO60682 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MSCO60682 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSCO60682 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSCO60682 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSCO60682 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSCO60682 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSCO60682 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSCO60682 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MSCO60682 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSCO60682 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSCO60682 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSCO60682 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSCO60682 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSCO60682 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MSCO60682 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSCO60682 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSCO60682 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MSCO60682 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSCO60682 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSCO60682 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSCO60682 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MSCO60682 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSCO60682 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSCO60682 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSCO60682 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MSCO60682 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MSCO60682 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MSCO60682 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms