Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCO2O43819 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCO2O43819 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCO2O43819 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCO2O43819 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCO2O43819 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCO2O43819 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCO2O43819 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCO2O43819 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCO2O43819 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCO2O43819 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCO2O43819 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCO2O43819 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCO2O43819 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCO2O43819 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCO2O43819 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCO2O43819 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCO2O43819 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCO2O43819 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCO2O43819 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCO2O43819 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCO2O43819 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCO2O43819 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCO2O43819 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCO2O43819 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCO2O43819 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCO2O43819 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCO2O43819 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCO2O43819 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCO2O43819 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCO2O43819 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCO2O43819 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCO2O43819 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCO2O43819 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCO2O43819 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SCO2O43819 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCO2O43819 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCO2O43819 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCO2O43819 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCO2O43819 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCO2O43819 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCO2O43819 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCO2O43819 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCO2O43819 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCO2O43819 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCO2O43819 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCO2O43819 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCO2O43819 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCO2O43819 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCO2O43819 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCO2O43819 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCO2O43819 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCO2O43819 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCO2O43819 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCO2O43819 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCO2O43819 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCO2O43819 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCO2O43819 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCO2O43819 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCO2O43819 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCO2O43819 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCO2O43819 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCO2O43819 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCO2O43819 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCO2O43819 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCO2O43819 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCO2O43819 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCO2O43819 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCO2O43819 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCO2O43819 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCO2O43819 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCO2O43819 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCO2O43819 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCO2O43819 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCO2O43819 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCO2O43819 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCO2O43819 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCO2O43819 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCO2O43819 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCO2O43819 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCO2O43819 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCO2O43819 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCO2O43819 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCO2O43819 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCO2O43819 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCO2O43819 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCO2O43819 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCO2O43819 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCO2O43819 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCO2O43819 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCO2O43819 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCO2O43819 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCO2O43819 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCO2O43819 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCO2O43819 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCO2O43819 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCO2O43819 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCO2O43819 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCO2O43819 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCO2O43819 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms