Protein–RNA interactions for Protein: O43633

CHMP2A, Charged multivesicular body protein 2a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2AO43633 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHMP2AO43633 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CHMP2AO43633 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHMP2AO43633 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms