Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A4O43246 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC7A4O43246 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A4O43246 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms