Protein–RNA interactions for Protein: O14578

CIT, Citron Rho-interacting kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITO14578 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CITO14578 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CITO14578 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CITO14578 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CITO14578 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CITO14578 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CITO14578 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CITO14578 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CITO14578 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CITO14578 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CITO14578 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CITO14578 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CITO14578 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CITO14578 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CITO14578 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CITO14578 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CITO14578 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CITO14578 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CITO14578 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CITO14578 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CITO14578 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CITO14578 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CITO14578 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CITO14578 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CITO14578 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CITO14578 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CITO14578 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CITO14578 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CITO14578 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CITO14578 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CITO14578 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CITO14578 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CITO14578 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CITO14578 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CITO14578 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CITO14578 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CITO14578 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CITO14578 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CITO14578 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CITO14578 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CITO14578 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CITO14578 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CITO14578 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CITO14578 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CITO14578 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CITO14578 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CITO14578 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CITO14578 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CITO14578 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CITO14578 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CITO14578 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CITO14578 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CITO14578 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CITO14578 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CITO14578 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CITO14578 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CITO14578 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CITO14578 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CITO14578 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CITO14578 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CITO14578 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CITO14578 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CITO14578 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CITO14578 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CITO14578 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CITO14578 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CITO14578 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CITO14578 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CITO14578 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CITO14578 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CITO14578 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CITO14578 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CITO14578 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CITO14578 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CITO14578 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CITO14578 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CITO14578 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CITO14578 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CITO14578 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CITO14578 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CITO14578 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CITO14578 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CITO14578 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CITO14578 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CITO14578 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CITO14578 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CITO14578 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CITO14578 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CITO14578 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CITO14578 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CITO14578 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CITO14578 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CITO14578 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CITO14578 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CITO14578 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CITO14578 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CITO14578 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CITO14578 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CITO14578 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CITO14578 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms