Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NR2E3Q9Y5X4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NR2E3Q9Y5X4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms