Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PKP3Q9Y446 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PKP3Q9Y446 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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