Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ABCF2Q9UG63 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ABCF2Q9UG63 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ABCF2Q9UG63 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms