Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mpdu1Q9R0Q9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms