Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HPF1Q9NWY4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
HPF1Q9NWY4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms