Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KLHL11Q9NVR0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KLHL11Q9NVR0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KLHL11Q9NVR0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms