Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GKN1Q9NS71 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GKN1Q9NS71 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms