Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS45Q9NRW7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS45Q9NRW7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms