Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRDM8Q9NQV8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM8Q9NQV8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms