Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CYLDQ9NQC7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CYLDQ9NQC7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms