Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NRIP3Q9NQ35 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NRIP3Q9NQ35 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NRIP3Q9NQ35 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms