Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNPLA8Q9NP80 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PNPLA8Q9NP80 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PNPLA8Q9NP80 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms