Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TUFT1Q9NNX1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUFT1Q9NNX1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms