Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SHARPINQ9H0F6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHARPINQ9H0F6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms