Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lhfpl3Q9CTN8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lhfpl3Q9CTN8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms