Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
BHLHE41Q9C0J9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BHLHE41Q9C0J9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms