Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT23Q9C075 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KRT23Q9C075 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms