Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FOXP3Q9BZS1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FOXP3Q9BZS1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms