Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRRTQ9BXP5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRRTQ9BXP5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms