Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTN0

LRFN3, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN3Q9BTN0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRFN3Q9BTN0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRFN3Q9BTN0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRFN3Q9BTN0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms