Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TM2D3Q9BRN9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms