Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MESP1Q9BRJ9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MESP1Q9BRJ9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms