Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MYD88Q99836 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MYD88Q99836 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MYD88Q99836 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms