Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAD9AQ99638 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAD9AQ99638 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAD9AQ99638 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms