Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHOX2BQ99453 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms